“三审复核制”既定，平反工作的关键便落在了巡按御史的选派之上。萧燊心中清楚，巡按御史是平反工作的一线执行者，直接面对地方的复杂局势与各种阻力，若所选御史贪赃枉法、畏惧权贵，或是能力不足、敷衍了事，那么整场冤狱平反之举都可能沦为空谈，不仅无法安抚民心，反而会加剧百姓的不满。因此，他对巡按御史的人选极为重视，亲自拟定选拔标准，要求吏部与都察院严格筛选，宁缺毋滥。

萧燊拟定的选拔标准清晰而严苛，主要涵盖三个方面：其一，品行端方，出身清白，无任何贪腐劣迹与不良记录，需经玄夜卫暗中核查确认，确保其心术纯正；其二，精通律法，具备丰富的地方司法办案经验，能够准确判断案件疑点，擅长从复杂的案卷与口供中梳理出真相，有过平反冤假错案经历者优先考量；其三，不畏权贵，敢于直言进谏，在面对压力与诱惑时能够坚守本心，曾因弹劾奸佞官员被贬谪却依然刚正不阿者，将作为重点选拔对象。

按照萧燊的要求，吏部尚书沈敬之与左都御史虞谦亲自牵头选拔工作，两人从全国各州府、各部院的官员中，初步筛选出二十五名符合基本条件的候选人。为进一步考察候选人的真实能力与政治立场，萧燊特意亲自主持殿试，以“如何高效推进冤狱平反”“面对地方官员阻挠该如何应对”“如何平衡平反效率与审理公正”等实际问题为题，让候选人当场作答，同时观察他们的言行举止与应对态度，全面考察其见识、决心与应变能力。

经过层层筛选与严格考察，最终十三名优秀官员脱颖而出，成为此次分赴十三省的巡按御史。这十三人中，既有像江西按察使江涛这样，曾因弹劾魏党权贵而被贬至西南烟瘴之地，复职后依然敢言不讳、刚正不阿的资深官员；也有一些在地方任职时，凭借公正办案、为民做主而深得民心的年轻官员，他们充满干劲，对平反冤狱充满热情。选定人选后，萧燊在御书房亲自召见十三名御史，亲手将“尚方宝剑”赐予每位御史，训话道：“尔等持此剑，上可纠弹不法官员，下可昭雪民间冤情，凡有官员阻挠平反、销毁证据、串通舞弊者，尔等可先斩后奏，无需事事禀报！朕望尔等不负圣命，不负百姓期盼，深入地方，细致核查，还天下一个朗朗乾坤！”

十三名巡按御史郑重接过尚方宝剑，向萧燊叩首谢恩，齐声领命：“臣等必不负陛下圣恩，不负百姓所托！”领命之后，他们不敢有丝毫耽搁，即刻收拾行装，自带精心挑选的文书吏员与玄夜卫护卫——玄夜卫负责保护其安全，同时协助核查证据、抓捕嫌犯——避开地方官员的刻意拉拢与宴请，日夜兼程奔赴各自负责的省份，直奔各州府，正式启动冤狱核查工作，一场覆盖全国的平冤风暴就此拉开序幕。

巡按御史抵达各自负责的省份后，没有先与地方官员接触，而是第一时间在各州府的繁华地段、城门入口等百姓聚集之处张贴告示，告示上清晰写明朝廷平反冤狱的旨意、“三审复核制”的具体流程，以及御史行辕的地址与申诉时间，晓谕百姓：“凡蒙冤受屈者，无论案件大小、历时多久，均可持状纸、证据赴御史行辕申诉，朝廷必秉公审理，绝不推诿、绝不偏袒！”告示一经张贴，即刻引发百姓热议，各地百姓纷纷响应，短短几日之内，各州府的御史行辕外便排起了长长的申诉队伍，不少百姓带着积攒多年的冤屈与证据，满怀期待地等候申诉。

在百姓申诉的同时，地方有司的初审工作也随即展开。按照“三审复核制”的要求，各州府知府需在一个月内，将辖区内所有未结案件、历年积压案件的案卷全部整理完毕，逐一登记造册，提交给巡按御史审阅。然而，这一要求在执行过程中却遭遇了诸多阻碍，部分曾参与制造冤狱、或是与旧党有着千丝万缕联系的地方官员，心存侥幸心理，妄图通过各种手段蒙混过关：